تتمثل وظيفة الفجوات في الخلية عامةً بما يلي:
- الاحتفاظ بنسب من الماء الذي تحتاج إليه الخلية النباتية.
- فصل المواد الضارة عن بقية المكونات داخل الخلية.
- موازنة الضغط في أنحاء الخلية.
- موازنة واستقرار درجات الحموضة في الخلايا.
- الاحتفاظ بالبروتينات وتخزينها لتعزيز إنبات البذور.
- طرح المنتجات وتصديرها خارج الخلية.
- أداء دور الالتهام الذاتي وتعزيز التكون الحيوي ودعمهما.
- تدمير البروتينات والهياكل المرفوضة.
- إلحاق الدمار بالبكتيريا الضارة والإبقاء على المفيدة منها.
- تخزين الأحماض بمختلف أشكالها على هيئة أملاح، منها التفاح، الحماض Oxalique وحمض الليمون وغيرها.