لكل مستحدث مجموعة من المميزات والعيوب في نفس الوقت حيث تشهد تكنولوجيا التعليم مجموعة كبيرة من العقبات التي تقف أمام تطبيقها وتتمثل في الأتي:
- إبتعاد المعلمين عن كل ما هو جديد والخوف من التقنية وربما يكون الخوف الأكبر من خسارة المكانة الإجتماعية أو الدور بين الطلاب فيريد أن يصبح هو المصدر الوحيد للتعلم.
- الجهل التكنولوجي الذي يقع عقبة أمام الطلاب والمعلمين في نفس الوقت ويقصد به عدم القدرة على توظيف التكنولوجيا في التعليم بطريقة صحيحة مما يقلل الفائدة من تطبيقة.
- الميزانية الكبيرة حيث أن تطبيق أليات ومستحدثات تكنولوجيا التعليم بحاجة إلى ميزانية كبيرة وأليات حديثة بالإضافة للأجهزة والشبكات والأدوات المادية والبرمجية.
- تدريب الكوادر البشرية وتأهيلها، وهذا يوقع الكثير من المسؤولية على النظام التعليمي كما أنه يحتاج لوقت كبير من أجل تدريبهم بطريقة جيدة وفعالة .
- بعض المشكلات الإدارية والتقنية التي تؤثر بدورها على فاعلية النظام.
- عدم ملائم التكنولوجيا لكل المواد العلمية حيث أنه لابد من تصميم برمجيات ونظم فرعية تعمل على دمج التعلم التقليدي مع التعلم الإلكتروني لمزيد من الإفادة.